L'histoire de Jonathan ne commence pas par « Il était une fois » ni par des parents riches et pleins d'amour. Sa vie débute dans la banlieue de Gotham City, là où se pressent les pauvres travailleurs acharnés, les malfaiteurs de bas niveau et les voleurs de nourriture. Là où ceux qui ont un petit appartement aux carreaux de fenêtre brisés et aux rideaux déchirés sont considérés comme chanceux. Jonathan et ses parents étaient « chanceux », car Mr Crane était parvenu à conserver son emploi dans une usine à la chaîne depuis bientôt dix ans. Pourquoi avoir fait un enfant dans ces conditions de pauvreté ? Parce qu'un soir d'hiver il faisait bon pour Monsieur et Madame Crane de se serrer l'un contre, sous la même couverture, à la lumière d'une faible bougie dont la cire avait tâché le meuble en bois sur laquelle elle reposait. Et parce que parfois on se dit que ce n'est pas grave si on ne se protège pas cette fois ci, parce que ça ne peut pas nous arriver à nous. Et parce que quand la nouvelle d'un futur enfant leur sauta au visage, Madame Crane n'imaginait pas avorter, et même si elle avait voulu ils n'auraient pas eu les moyens de lui payer l’hôpital. De là à dire que le petit Jonathan n'était pas désiré, il y'a une marge. Il était simplement mal tombé. Comme le licenciement économique de son père quelques mois après sa naissance.

Néanmoins, les problèmes financier de ses parents n'empêchèrent pas le jeune garçon de rentrer à l'école à l'âge normal avec l'espoir secret de faire de longues études qui le mèneraient à une vie aisée. Mais ce fut sûrement la plus douloureuse période de sa vie car il était la risée de tous. Humiliation, moqueries, bizutage ; il y avait le droit tous les jours pour d'innombrables raisons. Sa faible corpulence faisant de lui un être frêle, fragile et facile à torturer. Sa pauvreté qui lui noircit encore plus vite sa réputation. Et ce surnom, l’Épouvantail, qui le suivit très longtemps. Avec sa tête de premier de la classe, il n'échappait jamais aux pires traitements des autres élèves. Malgré tout, il parvint à conserver de bons résultats qui lui permirent de franchir les examens avec facilité. Mais l'époque tragique que fut sa scolarité forgea son caractère à devenir rancunier, et le poussa même à de sérieux troubles mentaux qui se répercutèrent lorsqu'il fut plus vieux. Seulement en attendant, il restait muet et inoffensif face à la douleur qui lui était infligée chaque jour. Il n'osait pas, ne pouvait pas se rebeller.

La mince barrière qui le séparait de la folie complète et de la vilenie fut franchie lorsqu'il apprit que sa petite amie n'avait jamais été sincère et qu'il s'agissait d'un complot pour se moquer de lui encore une fois. Haineux et profondément blessé, il décida de se venger en leur offrant la frayeur de leur vie. Alors que son ex petite amie, le véritable copain de cette dernière et des amis à eux étaient en voiture, il surgit devant eux avec une arme ainsi qu'un sac de toile sur la tête, sac à l'effigie de l’Épouvantail qui devint son nom de vilain. Il n'avait pas prévu que le chauffeur paniquerait et causerait un accident mortel à tous les passagers de l'automobile. S'il regrettait son acte ? Non justement. Même si ce crime n'était pas prémédité, il n'en restait pas moins insensible à la mort de ces individus l'ayant humilié et fait souffrir. Jamais personne ne sut qu'il était à l'origine du décès des autres jeunes, chacun imaginant un simple et malheureux accident de la route. Alors il continua sa vie et quitta la faculté de psychologie où il était avec d'excellents résultats qui lui permirent de s'élever rapidement dans la société. Il devint professeur de psychologie dans une autre université de Gotham, seulement ses expériences malsaines sur la santé mentale de certains élèves lui valurent son renvoi de l'établissement.

Néanmoins, sa carrière de psychologue ne s'arrête pas là et il rejoins l'équipe médicale de l'asile d'Arkham en tant que spécialiste des phobies -dont il se sert secrètement contre ses ennemis. Mais lorsque la Ligue des Ombres fait son apparition dans Gotham pour en détruire la population afin d'entamer une nouvelle ère, il est manipulé et son intelligence est mise au service de cette opération. Engagé pour créer en masse le produit qu'il utilise avec son masque pour effrayer ses victimes et les traumatiser, il est tout de même arrêté par Batman et se fait oublier pendant un moment. Seulement la mort de Dent et la disparition du héros masqué sont pour lui l'occasion de ressortir son masque de toile et de semer de nouveau la terreur dans les esprits les plus tourmentés...